Procedura de evaluare a propunerilor de proiecte este descrisă în Instrucțiunea pentru Utilizatori privind înaintarea propunerilor de proiecte pentru finanțare din Fondul Național pentru Dezvoltare Regională. Instrucțiunea poate fi descărcată de pe paginile web ale Agențiilor de Dezvoltare Regională www.adrnord.md, www.ardcentru.md, www.adrsud.md, precum și a Ministerului Dezvoltării Regionale și Construcțiilor (www.mcdr.gov.md).